1966 yılında Karaman’da doğan Eyüp Debik, Karaman İmam Hatip Lisesi’nden 1987, İstanbul Teknik Üniversitesi İnşaat Fakültesi Çevre Mühendisliği Bölümü’nden 1992 yılında mezun oldu.
Yıldız Teknik Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Çevre Mühendisliği Bölümü’nde başladığı yüksek lisans eğitimini 1995, doktora eğitimini ise 1999 yılında tamamladı. Yüksek lisans ve doktora döneminde su ve atıksu arıtımı üzerine çalışmalar yapan Eyüp Debik, 2002-2004 yılları arasında Amerika’nın Iowa State Üniversitesi’nde ziyaretçi profesör unvanıyla atıksuların anaerobik arıtımı üzerine çeşitli araştırmalarda bulundu.
2000 yılında YTÜ Çevre Mühendisliği Bölümü’nde Yrd. Doç. Dr. kadrosuna atanan Eyüp Debik, 26 Nisan 2010 tarihinde Doçent ve 14 Eylül 2015 tarihinde Profesör unvanı aldı. Çevre mühendisliği alanında 6 doktora ve 12 yüksek lisans talebesi yetiştiren Eyüp Debik, akademik hayatı boyunca, 2006-2008 ve 2011- 2014 yıllarında Yıldız Teknik Üniversitesi Çevre Mühendisliği Bölüm Başkan Yardımcılığı, 2007-2010 yıllarında Fakülte Kurulu ve Fakülte Yönetim Kurulu Üyeliği, 2008-2016 yıllarında Rektör Danışmanlığı, 2014-2020 yıllarında Meslek Yüksek Okulu Müdürlüğü, Mesleki Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü ile Yıldız Teknoloji Transfer Ofisi A.Ş. Yönetim Kurulu Başkanı olarak yönetim kademelerinde bulundu.
2009-2011 yılları arasında dönemin İstanbul Büyükşehir Belediyesi Genel Sekreteri Prof. Dr. Adem Baştürk’ün danışmanlığı görevinde bulunan Eyüp Debik, 2013-2015 yılları arasında ise Ergene Havzası Eylem Planı kapsamında dönemin Tekirdağ Valisi, T.C. İçişleri Bakanı Sayın Ali Yerlikaya ile çalışmalar gerçekleştirdi.
Prof. Dr. Eyüp Debik, sosyal sorumluluk çalışmaları kapsamında Çevre Kuruluşları Dayanışma Derneği (ÇEKUD) ve Su Vakfı gibi çeşitli sivil toplum kuruluşlarının faaliyetlerine destek verdi.
100’den fazla ulusal ve uluslararası yayın, 7 kitap ve kitapta bölüm yazarlığı, 5 patent ve faydalı model sahibi olan Prof. Dr. Debik, bugüne kadar 18’den fazla ulusal ve uluslararası projede yürütücü ve araştırmacı olarak çalışmalar yaptı.
T.C. Cumhurbaşkanlığı’nın 20 Eylül 2024 tarihli ve 2024/337 sayılı kararıyla Yıldız Teknik Üniversitesi Rektörlüğüne atanan Prof. Dr. Eyüp Debik, evli ve 3 çocuk sahibi olup iyi derecede İngilizce bilmektedir.